On attribue au microbiote intestinal un rôle de plus en plus important dans les coliques et les pleurs excessifs. Surtout après la naissance, les premiers colonisateurs sont importants pour la formation d'une barrière intestinale saine et la modulation des réponses immunitaires locales et systémiques. Des études ont montré que le méconium contient déjà un microbiome diversifié et que la colonisation de l'intestin du nourrisson commence in utero. [1]

Conception de l'étude : L'étude de cohorte prospective basée sur la population a recueilli le méconium de 212 nouveau-nés consécutifs, analysé son microbiome et évalué s'il existe une association avec des coliques infantiles ultérieures. Un an plus tard, des échantillons de selles supplémentaires ont été prélevés sur les sujets (n = 96) pour analyser si leur composition pouvait encore être liée aux coliques chez ces enfants d'un an. 

Résultats : Le microbiome méconial chez les nourrissons diagnostiqués avec des coliques infantiles (n = 19) était différent de celui des nourrissons ne souffrant d'aucun symptôme (n = 139) : les nourrissons souffrant de coliques avaient une abondance relative plus faible de phylum Firmicutes (27 % contre 46 % , p = 0,008) et Lactobacillus (0,54 % vs 4,6 %, p = 0,04) dans leur méconium. Cette différence ne pouvait plus être détectée dans les échantillons de suivi prélevés un an plus tard.
Selon une classification forestière aléatoire, le microbiome des premières selles prédisait les coliques ultérieures avec une aire sous la courbe (AUC) de 0,66 (SD 0,04) par rapport au hasard (p < 0,001). Aucune différence n'a été trouvée entre les nourrissons avec coliques et les nourrissons sans coliques en ce qui concerne le nombre d'UTO (unités taxonomiques opératoires) et l'indice de Shannon pour évaluer la diversité bactérienne.